自分で調べたわけでも何でもないのですが、情報ソースが全然なかったので、備忘録としてリンクを貼らせていただきます。yossyさん、ありがとうございます。

PHP5でfgetcsvが正常に動作しない

この、fgetcsv_reg()
という関数はとてfgetcsvと同じように使えるので、
プログラムもほとんどそのままで使いまわせてとても便利です。